Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms