Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhobP62746 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhobP62746 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhobP62746 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhobP62746 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhobP62746 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms