Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm2P58774 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms