Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Paxbp1P58501 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms