Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rp1P56716 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms