Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CckbrP56481 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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