Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CartptP56388 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CartptP56388 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CartptP56388 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CartptP56388 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms