Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aqp4P55088 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms