Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrlP54846 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrlP54846 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrlP54846 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrlP54846 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NrlP54846 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms