Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Faf1P54731 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms