Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lbx1P52955 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lbx1P52955 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lbx1P52955 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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