Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pold1P52431 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms