Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms