Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms