Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epb42P49222 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms