Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VdrP48281 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VdrP48281 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VdrP48281 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VdrP48281 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms