Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms