Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms