Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtbP41155 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtbP41155 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtbP41155 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtbP41155 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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