Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh4P39038 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms