Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms