Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm4P32211 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm4P32211 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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