Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd3P30282 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms