Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxraP28700 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxraP28700 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxraP28700 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxraP28700 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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