Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BgnP28653 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BgnP28653 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BgnP28653 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BgnP28653 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BgnP28653 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BgnP28653 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BgnP28653 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BgnP28653 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BgnP28653 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BgnP28653 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms