Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms