Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb1P28230 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms