Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde6aP27664 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pde6aP27664 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde6aP27664 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde6aP27664 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde6aP27664 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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