Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou2f1P25425 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms