Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria1P23818 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms