Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm18200-201ENSMUST00000173265 833 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm18190-201ENSMUST00000174801 832 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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