Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsta3P23591 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms