Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RarbP22605 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RarbP22605 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RarbP22605 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RarbP22605 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RarbP22605 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RarbP22605 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RarbP22605 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RarbP22605 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RarbP22605 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RarbP22605 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RarbP22605 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RarbP22605 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms