Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk1P22518 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clk1P22518 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clk1P22518 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clk1P22518 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms