Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prim1P20664 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prim1P20664 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms