Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RargP18911 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RargP18911 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RargP18911 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RargP18911 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RargP18911 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RargP18911 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RargP18911 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RargP18911 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RargP18911 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RargP18911 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RargP18911 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms