Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms