Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18524 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18524 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18524 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18524 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18524 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18524 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18524 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18524 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P18524 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms