Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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