Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms