Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a1P12813 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms