Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtcP11725 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtcP11725 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtcP11725 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtcP11725 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtcP11725 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtcP11725 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OtcP11725 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OtcP11725 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms