Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms