Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P10404 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P10404 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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P10404 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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P10404 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P10404 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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P10404 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P10404 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P10404 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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