Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Becn2P0DM65 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Becn2P0DM65 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms