Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf2P09926 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms