Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa9P09631 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms