Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc8P09025 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms