Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtrP07309 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtrP07309 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TtrP07309 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtrP07309 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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