Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa4P06728 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms